Из-за строительства высотной Асуанской плотины вода в Ниле по расчетам должна была повыситься на 62 м над уровнем моря, поглотив вокруг себя все строения как современные, так и древние. Чтобы этого не допустить, во второй половине 60-х годов в этой местности была проведена масштабная операция, призванная спасти древние памятники Нубии. Проходила она под эгидой ЮНЕСКО, материально поддержало ее и мировое сообщество, а сутью ее являлся демонтаж, перевозка и сборка (на новом месте) храмов Абу-Симбела и о. Филе.

Нубийский музей в Асуане, стал местом, где сохранили культуру исчезнувшей земли. Этот музей хоть и один из самых молодых музеев Египта, его считают важнейшей сокровищницей памятников древнеегипетских цивилизаций. Здание музея, которое сочетает в себе нубийские и древнеегипетские архитектурные традиции, соорудили на ступенчатых террасах неподалеку от древних каменоломен.

Нубийский музей расположен на окраине Асуана, в южной части горда, занимая площадь 50 тыс. м², при этом выставочные залы, библиотека, учебные помещения и прочие здания занимают только 7 тыс. м². Остальная же площадь - это великолепный зелёный парк, окружающий здание. Руководит музеем со дня его основания известный учёный-египтолог, доктор Оссама Абд эль Маджид.

Общий архитектурный проект здания музея выполнил египетский архитектор Махмуд Эль-Хаким, который также был автором Луксорского музея. В 2001 г. Нубийский музей наградили престижной премией Ага Хана в области архитектуры.

В коллекции музея насчитывается более 3000 экспонатов, которые были найдены городах и храмах Нубии. Интерьер музея выполнен с использованием ряда элементов, которые характерны для нубийской архитектуры. Для отделки стен и полов помещений использовали местные материалы, среди которых и розовый мрамор. Потолки украшены ажурными деревянными решетками.

Центральным экспонатом музейного комплекса является гигантский восьмиметровый макет Нубии, на котором представлены древние города и храмы. По массивной лестнице можно спуститься с первого зала вниз, где находится восьмиметровый колосс Рамсеса II, выполненный из песчаника и раньше находившийся во дворе храма Рамсеса II в Герф Хуссейне.

Также в коллекции Нубийского музея присутствуют уникальные мумии священных овнов бога Хнума, статуи правителей Асуана эпохи Среднего царства, элементы солнечного и лунного святилищ, когда-то находившихся перед храмом Рамсеса II в Абу-Симбеле.

Из Египетского музея (Каир) перевезли статуи правителей страны, который имели нубийское происхождение, в их числе фараон XXV династии Тахарки, его сестра Аменердис II, а также Анхнеснеферибра II - последняя верховная жрица Амона Фиванского, занимающая этот пост перед завоеванием Египта персами в 525 г. до н. э.

Наружная выставочная зона, изображающая долину Нила, демонстрирует пещерные доисторические рисунки зверей, традиционный дом Нубии, театр, вмещающий 500 человек, две усыпальницы, а также захоронения Фатимидов, римлян и коптов. Канал, имитирующий Нил, окаймляют изображения местной флоры и фауны.

Собрание музея разделёно на 5 отделов:
- доисторический,
- древнеегипетский и нубийский,
- античный и римский,
- коптский
- исламский.

Также представлены в Нубийском музее короны нубийских правителей, относящиеся к I—IV вв., изготовленные из драгоценных металлов и камней,  золотые предметы обихода, украшения.