Мемориальную церковь соорудили по проекту, разработанному архитектором Францом Швехтеном. Строительство длилось с 1891 года по 1895 год.

Возведена эта церковь в честь Вильгельма I, который был первым германским кайзером. Приказ о строительстве церкви выдал его внук Вильгельма II, последний кайзер Германии. Долгое время Мемориальная церковь кайзера Вильгельма считалась самой высокой церковью Берлина, благодаря своей высоте, которая составляла 113 м.

Но этой церкви в середине ХХ века судилось стать мемориалом разрушения и созидания. 23 ноября 1943 года незадолго после того, как закончилась проповедь в церкви, она была разрушена в результате бомбового налёта союзников. Это разрушен и послужило причиной того, что церковь является мемориалом в память о Второй Мировой Войне.

Вторая Мировая Война закончилась, и по прошествии нескольких лет было принято решение построить другую церковь на месте церкви кайзера Вильгельма. Но жители Берлина выступили против такого новшества, так как они хотели сохранить старый храм. Чтобы можно было объединить и желание возвести новую церковь, и не вызвать возмущение горожан, архитектором Эгоном Айгерманном был разработан особый план-проект. Он решил трансформировать старую башню, которая была разрушена, в уникальную восьмигранную церковь, а также отдельно построить гексагональную башню. Таким образом, в 1961 году был построен новый молитвенный зал поблизости разрушенной башни. Сегодня же башня является мемориальным залом, который предоставляет на обозрение золотые мозаики и фотографии, изображающие вид храма до и после бомбежки как напоминание о былом блеске церкви.

Мемориальная церковь застеклена стеклом синего цвета, но этого не видно снаружи. Зато изнутри это синее стекло приобретает очень красивый вид, когда сквозь него проходят лучи солнца. Громадная дверь Мемориальной церкви сделана из алюминия.

Туристы дали восстановленной и обновлённой церкви название «Синяя церковь», как раз из-за этих светящихся синим светом стёкол. Архитектура церкви содержит секрет такого свечения. Все дело в том, что источники света проходят между двумя стенами, которые находятся на расстоянии 2,70 м друг от друга. Эти источники света и освещают стёкла, которые вставлены в множество бетонных «сот», придавая стёклам таинственный синий цвет.

Примечательно и то, что над алтарём мемориальной церкви парит фигура вознёсшегося Христа. Эту фигуру создал Карл Хемметер из сплава меди и цинка. Высота фигуры - 4,60 м, а весит она почти 6 центнеров.